Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms