Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF11Q05519 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF11Q05519 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms