Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT17Q04695 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms