Protein–RNA interactions for Protein: Q04304

YMR090W, UPF0659 protein YMR090W, yeast

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR090W	Q04304	TMA19	YKL056C	504 nt		2.95	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	SMC3	YJL074C	3693 nt		2.95	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	PMT6	YGR199W	2280 nt		2.95	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	KTR7	YIL085C	1554 nt		2.95	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	ALO1	YML086C	1581 nt		2.95	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	TRS120	YDR407C	3870 nt		2.94	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	PKH1	YDR490C	2301 nt		2.94	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	MTR4	YJL050W	3222 nt		2.94	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	GPI1	YGR216C	1830 nt		2.94	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	YPR022C	YPR022C	3402 nt		2.94	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	SLX8	YER116C	825 nt		2.94	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	VFA1	YER128W	612 nt		2.94	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	PUG1	YER185W	912 nt		2.94	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	YFL065C	YFL065C	309 nt		2.94	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	TIP20	YGL145W	2106 nt		2.94	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	BCD1	YHR040W	1101 nt		2.94	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	YHR173C	YHR173C	339 nt		2.94	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	GAT3	YLR013W	426 nt		2.94	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	ASI2	YNL159C	870 nt		2.94	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	RPL18A	YOL120C	561 nt		2.94	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	YAR1	YPL239W	603 nt		2.94	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	TSR1	YDL060W	2367 nt		2.94	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	SYF1	YDR416W	2580 nt		2.94	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	CNM67	YNL225C	1746 nt		2.93	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	IML2	YJL082W	2196 nt		2.93	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	UPS3	YDR185C	540 nt		2.93	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	SPT3	YDR392W	1014 nt		2.93	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	YIL152W	YIL152W	708 nt		2.93	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	YIL163C	YIL163C	354 nt		2.93	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	YKT6	YKL196C	603 nt		2.93	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	REH1	YLR387C	1299 nt		2.93	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	MAC1	YMR021C	1254 nt		2.93	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	TVP18	YMR071C	504 nt		2.93	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	GLO4	YOR040W	858 nt		2.93	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	YBR196C-B	YBR196C-B	105 nt		2.93	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	RPA135	YPR010C	3612 nt		2.93	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	FLO9	YAL063C	3969 nt		2.93	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	GEM1	YAL048C	1989 nt		2.92	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	YEL025C	YEL025C	3567 nt		2.92	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	DPB4	YDR121W	591 nt		2.92	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	LNP1	YHR192W	837 nt		2.92	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	YHR214C-E	YHR214C-E	300 nt		2.92	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	YIR017W-A	YIR017W-A	600 nt		2.92	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	MAD2	YJL030W	591 nt		2.92	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	YAE1	YJR067C	426 nt		2.92	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	UTP11	YKL099C	753 nt		2.92	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	COX19	YLL018C-A	297 nt		2.92	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	YLR049C	YLR049C	1287 nt		2.92	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	VTA1	YLR181C	993 nt		2.92	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	YAR070C	YAR070C	300 nt		2.92	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	IBD2	YNL164C	1056 nt		2.92	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	YNL181W	YNL181W	1224 nt		2.92	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	GIS2	YNL255C	462 nt		2.92	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	YSP2	YDR326C	4317 nt		2.92	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	SWP82	YFL049W	1872 nt		2.91	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	tL(UAG)J	tL(UAG)J	82 nt		2.91	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	tL(UAG)L1	tL(UAG)L1	82 nt		2.91	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	tL(UAG)L2	tL(UAG)L2	82 nt		2.91	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	FLD1	YLR404W	858 nt		2.91	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	THR4	YCR053W	1545 nt		2.91	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	BYE1	YKL005C	1785 nt		2.91	□□□□□ -1.94
YMR090W	Q04304	BOI2	YER114C	3123 nt		2.9	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	MSW1	YDR268W	1140 nt		2.9	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	YFR045W	YFR045W	930 nt		2.9	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	SPN1	YPR133C	1233 nt		2.9	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	APN2	YBL019W	1563 nt		2.9	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	YLR177W	YLR177W	1887 nt		2.9	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	SSM4	YIL030C	3960 nt		2.9	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	STV1	YMR054W	2673 nt		2.89	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	GUS1	YGL245W	2127 nt		2.89	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	DAS2	YDR020C	699 nt		2.89	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	MIT1	YEL007W	2001 nt		2.89	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	BMH1	YER177W	804 nt		2.89	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	TFA1	YKL028W	1449 nt		2.89	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	YLR122C	YLR122C	378 nt		2.89	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	MVD1	YNR043W	1191 nt		2.89	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	INA17	YPL099C	549 nt		2.89	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	STU2	YLR045C	2667 nt		2.89	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	CHA4	YLR098C	1947 nt		2.89	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	SEO1	YAL067C	1782 nt		2.89	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	HOS2	YGL194C	1359 nt		2.88	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	MRE11	YMR224C	2079 nt		2.88	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	RSF2	YJR127C	4143 nt		2.88	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	BAR1	YIL015W	1764 nt		2.88	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	ECO1	YFR027W	846 nt		2.88	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	YJR096W	YJR096W	849 nt		2.88	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	PIR3	YKL163W	978 nt		2.88	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	GTR1	YML121W	933 nt		2.88	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	ARG5,6	YER069W	2592 nt		2.88	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	SPT16	YGL207W	3108 nt		2.88	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	YBL010C	YBL010C	843 nt		2.87	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	YOR292C	YOR292C	930 nt		2.87	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	NUP60	YAR002W	1620 nt		2.86	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	SYT1	YPR095C	3681 nt		2.86	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	RPS21A	YKR057W	264 nt		2.86	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	MMM1	YLL006W	1281 nt		2.86	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	YML053C	YML053C	639 nt		2.86	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	RFA2	YNL312W	822 nt		2.86	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	SUI3	YPL237W	858 nt		2.86	□□□□□ -1.95
YMR090W	Q04304	YMR018W	YMR018W	1545 nt		2.86	□□□□□ -1.95

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.5 ms