Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms