Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP27A1Q02318 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms