Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E2F1Q01094 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
E2F1Q01094 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F1Q01094 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F1Q01094 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F1Q01094 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F1Q01094 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F1Q01094 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F1Q01094 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F1Q01094 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F1Q01094 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F1Q01094 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F1Q01094 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F1Q01094 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F1Q01094 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F1Q01094 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F1Q01094 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F1Q01094 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F1Q01094 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F1Q01094 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F1Q01094 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F1Q01094 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F1Q01094 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F1Q01094 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.31■■□□□ 1
E2F1Q01094 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F1Q01094 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F1Q01094 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F1Q01094 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F1Q01094 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F1Q01094 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F1Q01094 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F1Q01094 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F1Q01094 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F1Q01094 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F1Q01094 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F1Q01094 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F1Q01094 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F1Q01094 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F1Q01094 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F1Q01094 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.3■■□□□ 1
E2F1Q01094 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F1Q01094 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F1Q01094 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F1Q01094 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F1Q01094 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F1Q01094 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F1Q01094 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F1Q01094 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F1Q01094 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F1Q01094 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F1Q01094 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F1Q01094 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F1Q01094 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F1Q01094 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F1Q01094 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F1Q01094 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F1Q01094 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E2F1Q01094 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E2F1Q01094 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F1Q01094 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms