Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms