Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HBBP68871 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBBP68871 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBBP68871 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBBP68871 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBBP68871 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBBP68871 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBBP68871 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBBP68871 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBBP68871 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBBP68871 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBBP68871 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBBP68871 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBBP68871 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBBP68871 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBBP68871 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HBBP68871 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HBBP68871 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HBBP68871 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HBBP68871 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HBBP68871 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HBBP68871 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HBBP68871 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HBBP68871 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HBBP68871 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HBBP68871 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HBBP68871 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HBBP68871 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HBBP68871 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HBBP68871 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HBBP68871 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HBBP68871 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HBBP68871 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HBBP68871 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HBBP68871 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HBBP68871 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HBBP68871 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HBBP68871 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HBBP68871 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HBBP68871 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HBBP68871 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HBBP68871 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HBBP68871 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HBBP68871 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HBBP68871 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HBBP68871 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HBBP68871 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HBBP68871 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HBBP68871 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HBBP68871 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HBBP68871 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HBBP68871 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HBBP68871 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HBBP68871 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HBBP68871 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HBBP68871 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HBBP68871 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HBBP68871 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HBBP68871 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HBBP68871 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBBP68871 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBBP68871 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBBP68871 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBBP68871 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBBP68871 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBBP68871 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBBP68871 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBBP68871 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HBBP68871 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBBP68871 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBBP68871 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBBP68871 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBBP68871 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBBP68871 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBBP68871 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms