Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TUBB4BP68371 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4BP68371 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms