Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBA52P62987 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBA52P62987 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBA52P62987 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBA52P62987 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBA52P62987 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBA52P62987 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBA52P62987 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBA52P62987 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBA52P62987 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBA52P62987 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBA52P62987 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBA52P62987 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBA52P62987 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBA52P62987 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBA52P62987 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBA52P62987 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBA52P62987 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBA52P62987 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBA52P62987 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBA52P62987 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
UBA52P62987 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBA52P62987 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBA52P62987 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBA52P62987 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBA52P62987 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBA52P62987 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBA52P62987 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBA52P62987 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBA52P62987 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBA52P62987 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBA52P62987 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBA52P62987 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBA52P62987 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBA52P62987 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBA52P62987 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBA52P62987 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBA52P62987 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBA52P62987 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBA52P62987 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
UBA52P62987 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBA52P62987 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBA52P62987 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBA52P62987 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBA52P62987 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBA52P62987 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBA52P62987 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBA52P62987 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBA52P62987 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBA52P62987 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBA52P62987 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBA52P62987 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBA52P62987 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBA52P62987 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBA52P62987 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBA52P62987 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBA52P62987 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBA52P62987 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBA52P62987 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBA52P62987 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBA52P62987 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBA52P62987 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBA52P62987 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBA52P62987 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBA52P62987 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBA52P62987 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBA52P62987 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBA52P62987 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBA52P62987 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UBA52P62987 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBA52P62987 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBA52P62987 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBA52P62987 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBA52P62987 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBA52P62987 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBA52P62987 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBA52P62987 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBA52P62987 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBA52P62987 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBA52P62987 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBA52P62987 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBA52P62987 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBA52P62987 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBA52P62987 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBA52P62987 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBA52P62987 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBA52P62987 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBA52P62987 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBA52P62987 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBA52P62987 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBA52P62987 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBA52P62987 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBA52P62987 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBA52P62987 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBA52P62987 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBA52P62987 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBA52P62987 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBA52P62987 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBA52P62987 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBA52P62987 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms