Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms