Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNRPEP62304 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms