Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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TMEM258P61165 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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TMEM258P61165 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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