Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP4P57796 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP4P57796 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP4P57796 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP4P57796 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP4P57796 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP4P57796 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP4P57796 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP4P57796 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP4P57796 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP4P57796 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP4P57796 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP4P57796 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP4P57796 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP4P57796 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP4P57796 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP4P57796 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP4P57796 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP4P57796 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP4P57796 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP4P57796 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP4P57796 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP4P57796 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP4P57796 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP4P57796 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP4P57796 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP4P57796 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP4P57796 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP4P57796 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP4P57796 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP4P57796 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP4P57796 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP4P57796 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP4P57796 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP4P57796 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP4P57796 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP4P57796 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP4P57796 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP4P57796 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP4P57796 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP4P57796 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP4P57796 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP4P57796 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP4P57796 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP4P57796 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP4P57796 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP4P57796 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP4P57796 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP4P57796 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP4P57796 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP4P57796 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP4P57796 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP4P57796 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP4P57796 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP4P57796 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP4P57796 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP4P57796 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP4P57796 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP4P57796 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP4P57796 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP4P57796 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP4P57796 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP4P57796 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP4P57796 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP4P57796 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP4P57796 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP4P57796 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP4P57796 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP4P57796 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP4P57796 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP4P57796 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP4P57796 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP4P57796 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP4P57796 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP4P57796 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP4P57796 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP4P57796 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP4P57796 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP4P57796 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP4P57796 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP4P57796 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP4P57796 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP4P57796 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP4P57796 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP4P57796 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP4P57796 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP4P57796 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CABP4P57796 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CABP4P57796 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP4P57796 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP4P57796 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP4P57796 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP4P57796 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP4P57796 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP4P57796 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP4P57796 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP4P57796 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP4P57796 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP4P57796 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP4P57796 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms