Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB25P57735 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB25P57735 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB25P57735 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB25P57735 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB25P57735 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB25P57735 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB25P57735 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB25P57735 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB25P57735 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB25P57735 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB25P57735 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB25P57735 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB25P57735 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB25P57735 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB25P57735 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB25P57735 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB25P57735 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB25P57735 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB25P57735 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB25P57735 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB25P57735 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB25P57735 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB25P57735 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB25P57735 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB25P57735 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB25P57735 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB25P57735 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB25P57735 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB25P57735 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB25P57735 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB25P57735 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB25P57735 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB25P57735 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB25P57735 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB25P57735 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB25P57735 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB25P57735 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB25P57735 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB25P57735 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB25P57735 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB25P57735 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB25P57735 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB25P57735 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB25P57735 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB25P57735 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB25P57735 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB25P57735 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB25P57735 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB25P57735 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB25P57735 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB25P57735 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB25P57735 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB25P57735 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB25P57735 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB25P57735 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB25P57735 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB25P57735 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB25P57735 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB25P57735 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB25P57735 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB25P57735 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB25P57735 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB25P57735 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB25P57735 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB25P57735 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB25P57735 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB25P57735 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB25P57735 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB25P57735 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB25P57735 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB25P57735 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB25P57735 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB25P57735 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB25P57735 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB25P57735 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB25P57735 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB25P57735 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB25P57735 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB25P57735 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms