Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFAP3P55082 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MFAP3P55082 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms