Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms