Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF135P52742 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms