Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCNKBP51801 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCNKBP51801 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms