Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms