Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGS4P49798 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGS4P49798 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGS4P49798 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RGS4P49798 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RGS4P49798 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RGS4P49798 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RGS4P49798 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGS4P49798 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGS4P49798 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGS4P49798 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGS4P49798 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RGS4P49798 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGS4P49798 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGS4P49798 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGS4P49798 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGS4P49798 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGS4P49798 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGS4P49798 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGS4P49798 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGS4P49798 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGS4P49798 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RGS4P49798 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGS4P49798 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGS4P49798 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGS4P49798 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGS4P49798 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGS4P49798 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RGS4P49798 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGS4P49798 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RGS4P49798 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGS4P49798 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGS4P49798 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGS4P49798 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGS4P49798 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGS4P49798 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGS4P49798 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGS4P49798 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGS4P49798 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGS4P49798 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGS4P49798 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGS4P49798 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGS4P49798 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGS4P49798 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGS4P49798 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGS4P49798 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGS4P49798 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGS4P49798 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGS4P49798 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGS4P49798 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGS4P49798 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGS4P49798 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGS4P49798 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGS4P49798 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms