Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA1P49639 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms