Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.054e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 STK25-217ENST00000442307 923 ntTSL 221.6■■□□□ 1.054e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.044e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.034e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TSPAN32-214ENST00000493924 1573 ntTSL 521.48■■□□□ 1.034e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.014e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TSPAN32-210ENST00000483227 886 ntTSL 1 (best)21.29■■□□□ 14e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.984e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MAEA-212ENST00000509531 1001 ntTSL 1 (best)21.19■□□□□ 0.984e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MAEA-206ENST00000503693 1182 ntTSL 1 (best)21.19■□□□□ 0.984e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.974e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.974e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.964e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-235ENST00000530848 688 ntTSL 321.03■□□□□ 0.964e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC6A6-205ENST00000613930 988 ntTSL 221.03■□□□□ 0.964e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TSPAN32-203ENST00000381117 798 ntTSL 1 (best)20.88■□□□□ 0.934e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TSPAN32-209ENST00000479508 741 ntTSL 220.88■□□□□ 0.934e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 VPS51-204ENST00000527646 2144 ntTSL 1 (best)20.84■□□□□ 0.934e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 GNB1L-206ENST00000481086 854 ntTSL 320.55■□□□□ 0.887e-8■■■■■ 30.6
AARSP49588 RTL10-204ENST00000416337 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.55■□□□□ 0.887e-8■■■■■ 30.6
AARSP49588 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.874e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PFKL-206ENST00000467315 1947 ntTSL 220.45■□□□□ 0.864e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TSPAN32-216ENST00000498313 988 ntTSL 520.32■□□□□ 0.844e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PLEC-214ENST00000528131 564 ntTSL 320.3■□□□□ 0.844e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-228ENST00000529832 600 ntTSL 420.27■□□□□ 0.844e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC6A6-203ENST00000610642 1983 ntTSL 220.15■□□□□ 0.824e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.824e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.814e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PKN1-204ENST00000585839 3518 ntTSL 220.1■□□□□ 0.814e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.814e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PPM1N-206ENST00000415077 1953 ntTSL 1 (best)20.03■□□□□ 0.84e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.794e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.94■□□□□ 0.784e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.774e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.764e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 STK25-211ENST00000429279 580 ntTSL 419.8■□□□□ 0.764e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 STK25-218ENST00000450497 882 ntTSL 519.78■□□□□ 0.764e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 GNB1L-205ENST00000460402 1197 ntTSL 319.7■□□□□ 0.747e-8■■■■■ 30.6
AARSP49588 PFKL-207ENST00000474114 6007 ntTSL 1 (best)19.63■□□□□ 0.734e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TSPAN32-215ENST00000493948 641 ntTSL 319.58■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.77e-8■■■■■ 30.6
AARSP49588 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.684e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 POLG-209ENST00000530715 372 ntTSL 319.31■□□□□ 0.684e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.664e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.664e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PKN1-212ENST00000590097 848 ntTSL 319.19■□□□□ 0.664e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-249ENST00000533749 633 ntTSL 519.1■□□□□ 0.654e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.644e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-209ENST00000524900 343 ntTSL 518.95■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC6A6-209ENST00000622176 1116 ntTSL 1 (best)18.84■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HERC2-208ENST00000566635 2114 ntTSL 1 (best)18.77■□□□□ 0.64e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.594e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-206ENST00000524397 957 ntTSL 318.71■□□□□ 0.594e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-224ENST00000529007 861 ntTSL 218.71■□□□□ 0.594e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC6A6-211ENST00000622810 565 ntTSL 418.44■□□□□ 0.544e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.534e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MAEA-216ENST00000512308 839 ntTSL 518.33■□□□□ 0.524e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PFKL-211ENST00000498841 3122 ntTSL 1 (best)18.32■□□□□ 0.524e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-250ENST00000533833 831 ntTSL 518.29■□□□□ 0.524e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.514e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PLEC-209ENST00000526416 583 ntTSL 318.26■□□□□ 0.514e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MAEA-203ENST00000502558 570 ntTSL 218.2■□□□□ 0.54e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 931 ntTSL 1 (best)18.18■□□□□ 0.54e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TSPAN32-202ENST00000339046 1202 ntTSL 218.09■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.484e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC6A6-206ENST00000615188 689 ntTSL 318.02■□□□□ 0.484e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 ACOT7-205ENST00000377860 1472 ntTSL 1 (best)17.91■□□□□ 0.464e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SAPCD1-210ENST00000433778 607 ntTSL 317.88■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MSH5-SAPCD1-208ENST00000498473 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)17.83■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SCARB1-205ENST00000538291 5527 ntTSL 517.77■□□□□ 0.444e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.434e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC35C2-211ENST00000487729 803 ntTSL 517.73■□□□□ 0.434e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HM13-219ENST00000487964 902 ntTSL 517.69■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TSPAN32-206ENST00000446063 1262 ntTSL 1 (best)17.61■□□□□ 0.414e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-244ENST00000532543 791 ntTSL 317.55■□□□□ 0.44e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MAEA-211ENST00000509254 598 ntTSL 417.46■□□□□ 0.394e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 CNN2-212ENST00000607102 307 ntTSL 1 (best)17.23■□□□□ 0.354e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.344e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 ACOT7-206ENST00000418124 1564 ntTSL 1 (best)17.16■□□□□ 0.344e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.344e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.334e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.334e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 NAB1-207ENST00000426601 545 ntTSL 417.02■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC35C2-208ENST00000481809 872 ntTSL 516.97■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC35C2-205ENST00000420518 588 ntTSL 316.92■□□□□ 0.34e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 STK25-208ENST00000423004 773 ntTSL 216.86■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-230ENST00000530191 853 ntTSL 316.78■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-231ENST00000530306 583 ntTSL 216.77■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.274e-6■■■■■ 30.6
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 197.7 ms