Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTDSS1P48651 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms