Protein–RNA interactions for Protein: P47897

QARS, Glutamine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QARSP47897 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
QARSP47897 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
QARSP47897 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
QARSP47897 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
QARSP47897 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
QARSP47897 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
QARSP47897 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
QARSP47897 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
QARSP47897 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
QARSP47897 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
QARSP47897 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
QARSP47897 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
QARSP47897 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
QARSP47897 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
QARSP47897 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
QARSP47897 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
QARSP47897 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
QARSP47897 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
QARSP47897 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
QARSP47897 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
QARSP47897 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
QARSP47897 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
QARSP47897 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
QARSP47897 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
QARSP47897 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
QARSP47897 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
QARSP47897 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
QARSP47897 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
QARSP47897 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
QARSP47897 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
QARSP47897 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
QARSP47897 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
QARSP47897 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
QARSP47897 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
QARSP47897 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
QARSP47897 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
QARSP47897 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
QARSP47897 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
QARSP47897 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
QARSP47897 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
QARSP47897 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
QARSP47897 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
QARSP47897 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
QARSP47897 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
QARSP47897 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
QARSP47897 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
QARSP47897 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
QARSP47897 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
QARSP47897 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
QARSP47897 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
QARSP47897 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
QARSP47897 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
QARSP47897 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
QARSP47897 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
QARSP47897 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
QARSP47897 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
QARSP47897 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
QARSP47897 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
QARSP47897 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
QARSP47897 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
QARSP47897 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
QARSP47897 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
QARSP47897 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
QARSP47897 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
QARSP47897 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
QARSP47897 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
QARSP47897 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
QARSP47897 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
QARSP47897 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
QARSP47897 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
QARSP47897 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
QARSP47897 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
QARSP47897 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
QARSP47897 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
QARSP47897 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
QARSP47897 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
QARSP47897 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
QARSP47897 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
QARSP47897 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
QARSP47897 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
QARSP47897 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
QARSP47897 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
QARSP47897 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
QARSP47897 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
QARSP47897 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
QARSP47897 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
QARSP47897 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
QARSP47897 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
QARSP47897 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
QARSP47897 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
QARSP47897 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
QARSP47897 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
QARSP47897 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
QARSP47897 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
QARSP47897 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
QARSP47897 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
QARSP47897 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
QARSP47897 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
QARSP47897 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
QARSP47897 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms