Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RECQLP46063 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RECQLP46063 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RECQLP46063 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RECQLP46063 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RECQLP46063 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RECQLP46063 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RECQLP46063 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RECQLP46063 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RECQLP46063 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RECQLP46063 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RECQLP46063 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RECQLP46063 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RECQLP46063 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RECQLP46063 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RECQLP46063 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RECQLP46063 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RECQLP46063 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RECQLP46063 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RECQLP46063 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RECQLP46063 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RECQLP46063 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RECQLP46063 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RECQLP46063 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RECQLP46063 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RECQLP46063 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RECQLP46063 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RECQLP46063 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RECQLP46063 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RECQLP46063 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RECQLP46063 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RECQLP46063 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RECQLP46063 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RECQLP46063 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RECQLP46063 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RECQLP46063 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RECQLP46063 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RECQLP46063 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RECQLP46063 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RECQLP46063 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RECQLP46063 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RECQLP46063 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RECQLP46063 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RECQLP46063 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RECQLP46063 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RECQLP46063 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RECQLP46063 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RECQLP46063 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RECQLP46063 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RECQLP46063 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RECQLP46063 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RECQLP46063 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RECQLP46063 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RECQLP46063 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RECQLP46063 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RECQLP46063 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RECQLP46063 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RECQLP46063 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RECQLP46063 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RECQLP46063 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RECQLP46063 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RECQLP46063 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RECQLP46063 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RECQLP46063 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RECQLP46063 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RECQLP46063 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RECQLP46063 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RECQLP46063 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RECQLP46063 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RECQLP46063 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RECQLP46063 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RECQLP46063 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RECQLP46063 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RECQLP46063 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RECQLP46063 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RECQLP46063 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RECQLP46063 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RECQLP46063 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RECQLP46063 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RECQLP46063 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RECQLP46063 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RECQLP46063 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RECQLP46063 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RECQLP46063 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RECQLP46063 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RECQLP46063 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RECQLP46063 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RECQLP46063 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RECQLP46063 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RECQLP46063 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RECQLP46063 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RECQLP46063 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RECQLP46063 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RECQLP46063 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RECQLP46063 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RECQLP46063 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RECQLP46063 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RECQLP46063 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RECQLP46063 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RECQLP46063 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms