Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms