Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARL1P40616 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARL1P40616 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARL1P40616 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARL1P40616 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARL1P40616 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARL1P40616 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARL1P40616 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARL1P40616 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL1P40616 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL1P40616 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL1P40616 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL1P40616 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL1P40616 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL1P40616 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL1P40616 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL1P40616 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL1P40616 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL1P40616 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL1P40616 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL1P40616 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL1P40616 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL1P40616 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL1P40616 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL1P40616 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL1P40616 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL1P40616 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL1P40616 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL1P40616 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL1P40616 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL1P40616 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL1P40616 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL1P40616 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL1P40616 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL1P40616 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL1P40616 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL1P40616 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL1P40616 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL1P40616 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARL1P40616 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARL1P40616 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARL1P40616 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARL1P40616 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARL1P40616 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARL1P40616 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARL1P40616 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARL1P40616 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARL1P40616 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARL1P40616 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARL1P40616 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARL1P40616 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARL1P40616 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARL1P40616 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARL1P40616 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARL1P40616 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL1P40616 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL1P40616 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL1P40616 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL1P40616 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL1P40616 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL1P40616 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL1P40616 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL1P40616 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL1P40616 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL1P40616 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL1P40616 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL1P40616 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL1P40616 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL1P40616 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL1P40616 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL1P40616 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL1P40616 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL1P40616 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL1P40616 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL1P40616 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL1P40616 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL1P40616 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL1P40616 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL1P40616 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL1P40616 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL1P40616 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL1P40616 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL1P40616 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms