Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSP1P33241 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSP1P33241 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSP1P33241 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSP1P33241 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSP1P33241 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSP1P33241 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSP1P33241 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSP1P33241 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSP1P33241 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSP1P33241 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSP1P33241 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LSP1P33241 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LSP1P33241 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSP1P33241 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSP1P33241 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSP1P33241 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSP1P33241 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSP1P33241 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSP1P33241 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSP1P33241 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSP1P33241 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSP1P33241 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LSP1P33241 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSP1P33241 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSP1P33241 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSP1P33241 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSP1P33241 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSP1P33241 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSP1P33241 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSP1P33241 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSP1P33241 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSP1P33241 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSP1P33241 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LSP1P33241 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LSP1P33241 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LSP1P33241 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSP1P33241 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSP1P33241 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSP1P33241 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSP1P33241 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSP1P33241 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSP1P33241 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSP1P33241 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSP1P33241 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSP1P33241 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSP1P33241 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSP1P33241 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSP1P33241 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSP1P33241 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSP1P33241 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSP1P33241 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSP1P33241 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSP1P33241 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSP1P33241 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSP1P33241 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSP1P33241 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSP1P33241 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSP1P33241 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSP1P33241 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSP1P33241 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSP1P33241 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSP1P33241 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSP1P33241 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSP1P33241 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSP1P33241 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LSP1P33241 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSP1P33241 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSP1P33241 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSP1P33241 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSP1P33241 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSP1P33241 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSP1P33241 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSP1P33241 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSP1P33241 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSP1P33241 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSP1P33241 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSP1P33241 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSP1P33241 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSP1P33241 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LSP1P33241 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSP1P33241 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSP1P33241 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSP1P33241 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSP1P33241 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSP1P33241 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSP1P33241 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSP1P33241 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSP1P33241 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSP1P33241 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSP1P33241 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSP1P33241 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSP1P33241 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSP1P33241 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSP1P33241 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LSP1P33241 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSP1P33241 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LSP1P33241 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LSP1P33241 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSP1P33241 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms