Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2H1P32780 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H1P32780 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms