Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A1P32418 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms