Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LMOD1P29536 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms