Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCAP28676 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCAP28676 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCAP28676 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCAP28676 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCAP28676 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCAP28676 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GCAP28676 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GCAP28676 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCAP28676 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCAP28676 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCAP28676 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCAP28676 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCAP28676 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCAP28676 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCAP28676 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GCAP28676 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCAP28676 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCAP28676 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCAP28676 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCAP28676 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCAP28676 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCAP28676 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCAP28676 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCAP28676 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCAP28676 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCAP28676 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCAP28676 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCAP28676 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCAP28676 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCAP28676 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCAP28676 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCAP28676 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCAP28676 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCAP28676 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCAP28676 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCAP28676 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCAP28676 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCAP28676 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCAP28676 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCAP28676 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCAP28676 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCAP28676 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCAP28676 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCAP28676 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCAP28676 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCAP28676 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCAP28676 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCAP28676 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCAP28676 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCAP28676 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCAP28676 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCAP28676 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCAP28676 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCAP28676 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCAP28676 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCAP28676 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCAP28676 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCAP28676 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCAP28676 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCAP28676 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCAP28676 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCAP28676 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCAP28676 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCAP28676 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCAP28676 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCAP28676 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCAP28676 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCAP28676 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCAP28676 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCAP28676 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCAP28676 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GCAP28676 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCAP28676 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCAP28676 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCAP28676 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCAP28676 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCAP28676 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCAP28676 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCAP28676 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCAP28676 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCAP28676 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCAP28676 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCAP28676 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCAP28676 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCAP28676 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCAP28676 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCAP28676 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCAP28676 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCAP28676 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCAP28676 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCAP28676 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCAP28676 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GCAP28676 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GCAP28676 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCAP28676 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCAP28676 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCAP28676 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCAP28676 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCAP28676 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms