Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTFRP26992 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTFRP26992 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms