Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCEA1P23193 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms