Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERBB3P21860 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERBB3P21860 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ERBB3P21860 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms