Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RCC1P18754 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCC1P18754 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCC1P18754 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCC1P18754 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCC1P18754 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCC1P18754 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCC1P18754 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCC1P18754 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RCC1P18754 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCC1P18754 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCC1P18754 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCC1P18754 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCC1P18754 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCC1P18754 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCC1P18754 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCC1P18754 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCC1P18754 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCC1P18754 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCC1P18754 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCC1P18754 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCC1P18754 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCC1P18754 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCC1P18754 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCC1P18754 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCC1P18754 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCC1P18754 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCC1P18754 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCC1P18754 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCC1P18754 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCC1P18754 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCC1P18754 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RCC1P18754 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCC1P18754 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCC1P18754 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCC1P18754 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCC1P18754 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCC1P18754 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCC1P18754 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCC1P18754 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCC1P18754 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCC1P18754 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCC1P18754 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCC1P18754 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCC1P18754 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RCC1P18754 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCC1P18754 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCC1P18754 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCC1P18754 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCC1P18754 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCC1P18754 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCC1P18754 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCC1P18754 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RCC1P18754 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RCC1P18754 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RCC1P18754 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCC1P18754 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCC1P18754 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCC1P18754 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCC1P18754 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCC1P18754 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCC1P18754 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCC1P18754 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RCC1P18754 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms