Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR1P18146 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR1P18146 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR1P18146 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR1P18146 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR1P18146 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR1P18146 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR1P18146 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR1P18146 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR1P18146 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR1P18146 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR1P18146 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR1P18146 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR1P18146 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR1P18146 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR1P18146 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR1P18146 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR1P18146 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR1P18146 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR1P18146 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR1P18146 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR1P18146 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR1P18146 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR1P18146 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR1P18146 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR1P18146 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR1P18146 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR1P18146 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR1P18146 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR1P18146 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR1P18146 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR1P18146 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR1P18146 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR1P18146 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR1P18146 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR1P18146 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR1P18146 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR1P18146 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR1P18146 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR1P18146 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR1P18146 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR1P18146 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR1P18146 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR1P18146 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR1P18146 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR1P18146 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR1P18146 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR1P18146 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR1P18146 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR1P18146 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR1P18146 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR1P18146 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR1P18146 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR1P18146 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR1P18146 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EGR1P18146 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR1P18146 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR1P18146 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR1P18146 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR1P18146 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR1P18146 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR1P18146 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR1P18146 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR1P18146 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR1P18146 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR1P18146 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR1P18146 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR1P18146 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR1P18146 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR1P18146 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR1P18146 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR1P18146 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EGR1P18146 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EGR1P18146 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms