Protein–RNA interactions for Protein: P15927

RPA2, Replication protein A 32 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA2P15927 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA2P15927 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA2P15927 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA2P15927 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA2P15927 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA2P15927 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA2P15927 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA2P15927 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA2P15927 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA2P15927 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA2P15927 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA2P15927 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA2P15927 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA2P15927 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA2P15927 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA2P15927 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA2P15927 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA2P15927 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA2P15927 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA2P15927 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA2P15927 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA2P15927 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA2P15927 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA2P15927 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA2P15927 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA2P15927 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA2P15927 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA2P15927 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA2P15927 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA2P15927 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA2P15927 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA2P15927 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA2P15927 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA2P15927 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA2P15927 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA2P15927 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA2P15927 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA2P15927 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA2P15927 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA2P15927 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA2P15927 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA2P15927 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA2P15927 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA2P15927 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA2P15927 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA2P15927 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA2P15927 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA2P15927 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA2P15927 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA2P15927 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA2P15927 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA2P15927 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA2P15927 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA2P15927 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA2P15927 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA2P15927 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA2P15927 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA2P15927 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA2P15927 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA2P15927 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA2P15927 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA2P15927 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA2P15927 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA2P15927 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA2P15927 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA2P15927 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA2P15927 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA2P15927 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA2P15927 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA2P15927 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA2P15927 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA2P15927 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA2P15927 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA2P15927 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA2P15927 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA2P15927 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA2P15927 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA2P15927 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA2P15927 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA2P15927 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA2P15927 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA2P15927 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA2P15927 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA2P15927 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA2P15927 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA2P15927 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPA2P15927 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA2P15927 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA2P15927 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA2P15927 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA2P15927 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA2P15927 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA2P15927 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA2P15927 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA2P15927 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA2P15927 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA2P15927 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA2P15927 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA2P15927 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPA2P15927 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms