Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF3P15923 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF3P15923 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF3P15923 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF3P15923 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF3P15923 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF3P15923 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF3P15923 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF3P15923 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF3P15923 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF3P15923 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF3P15923 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF3P15923 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF3P15923 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF3P15923 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF3P15923 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF3P15923 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF3P15923 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF3P15923 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF3P15923 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF3P15923 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF3P15923 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF3P15923 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF3P15923 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF3P15923 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF3P15923 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF3P15923 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF3P15923 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF3P15923 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF3P15923 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF3P15923 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF3P15923 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF3P15923 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF3P15923 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF3P15923 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF3P15923 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF3P15923 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF3P15923 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF3P15923 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF3P15923 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF3P15923 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF3P15923 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF3P15923 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF3P15923 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF3P15923 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF3P15923 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF3P15923 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF3P15923 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF3P15923 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF3P15923 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF3P15923 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF3P15923 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF3P15923 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF3P15923 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF3P15923 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF3P15923 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF3P15923 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF3P15923 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF3P15923 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF3P15923 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF3P15923 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF3P15923 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF3P15923 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF3P15923 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF3P15923 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF3P15923 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF3P15923 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF3P15923 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF3P15923 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF3P15923 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF3P15923 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF3P15923 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF3P15923 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF3P15923 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF3P15923 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF3P15923 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF3P15923 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF3P15923 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF3P15923 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms