Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FDPSP14324 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FDPSP14324 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FDPSP14324 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FDPSP14324 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FDPSP14324 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FDPSP14324 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FDPSP14324 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FDPSP14324 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FDPSP14324 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FDPSP14324 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FDPSP14324 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FDPSP14324 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FDPSP14324 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FDPSP14324 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FDPSP14324 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FDPSP14324 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FDPSP14324 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FDPSP14324 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FDPSP14324 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
FDPSP14324 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FDPSP14324 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FDPSP14324 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FDPSP14324 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FDPSP14324 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FDPSP14324 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FDPSP14324 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FDPSP14324 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FDPSP14324 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FDPSP14324 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FDPSP14324 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FDPSP14324 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FDPSP14324 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FDPSP14324 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FDPSP14324 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FDPSP14324 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FDPSP14324 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FDPSP14324 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FDPSP14324 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FDPSP14324 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FDPSP14324 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FDPSP14324 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FDPSP14324 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FDPSP14324 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FDPSP14324 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FDPSP14324 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FDPSP14324 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FDPSP14324 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FDPSP14324 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FDPSP14324 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FDPSP14324 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FDPSP14324 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FDPSP14324 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FDPSP14324 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FDPSP14324 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FDPSP14324 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FDPSP14324 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FDPSP14324 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FDPSP14324 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FDPSP14324 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FDPSP14324 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FDPSP14324 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FDPSP14324 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FDPSP14324 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FDPSP14324 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FDPSP14324 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FDPSP14324 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FDPSP14324 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FDPSP14324 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FDPSP14324 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FDPSP14324 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FDPSP14324 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FDPSP14324 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FDPSP14324 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FDPSP14324 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FDPSP14324 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FDPSP14324 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FDPSP14324 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FDPSP14324 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FDPSP14324 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FDPSP14324 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FDPSP14324 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FDPSP14324 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FDPSP14324 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FDPSP14324 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FDPSP14324 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FDPSP14324 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FDPSP14324 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FDPSP14324 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FDPSP14324 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FDPSP14324 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FDPSP14324 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FDPSP14324 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FDPSP14324 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FDPSP14324 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FDPSP14324 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FDPSP14324 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FDPSP14324 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FDPSP14324 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FDPSP14324 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms