Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-EP13747 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-EP13747 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms