Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A3P13637 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A3P13637 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms