Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms