Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAMP11215 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms