Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPP1P10451 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPP1P10451 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPP1P10451 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPP1P10451 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPP1P10451 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPP1P10451 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPP1P10451 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPP1P10451 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPP1P10451 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPP1P10451 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPP1P10451 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPP1P10451 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPP1P10451 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPP1P10451 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPP1P10451 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPP1P10451 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPP1P10451 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPP1P10451 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPP1P10451 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPP1P10451 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPP1P10451 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPP1P10451 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPP1P10451 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPP1P10451 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPP1P10451 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPP1P10451 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPP1P10451 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPP1P10451 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPP1P10451 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPP1P10451 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPP1P10451 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPP1P10451 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPP1P10451 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPP1P10451 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPP1P10451 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPP1P10451 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPP1P10451 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPP1P10451 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPP1P10451 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPP1P10451 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPP1P10451 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPP1P10451 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPP1P10451 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPP1P10451 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPP1P10451 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPP1P10451 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPP1P10451 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPP1P10451 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPP1P10451 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPP1P10451 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPP1P10451 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPP1P10451 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPP1P10451 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPP1P10451 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPP1P10451 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPP1P10451 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPP1P10451 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPP1P10451 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPP1P10451 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPP1P10451 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPP1P10451 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPP1P10451 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPP1P10451 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPP1P10451 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPP1P10451 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPP1P10451 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPP1P10451 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPP1P10451 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPP1P10451 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPP1P10451 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPP1P10451 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPP1P10451 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPP1P10451 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPP1P10451 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPP1P10451 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPP1P10451 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPP1P10451 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPP1P10451 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms