Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNMA6AP0CW24 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA6AP0CW24 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1515.6 ms