Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NGFRP08138 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NGFRP08138 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NGFRP08138 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NGFRP08138 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NGFRP08138 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NGFRP08138 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NGFRP08138 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NGFRP08138 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NGFRP08138 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NGFRP08138 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NGFRP08138 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NGFRP08138 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NGFRP08138 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NGFRP08138 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NGFRP08138 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NGFRP08138 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NGFRP08138 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NGFRP08138 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NGFRP08138 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NGFRP08138 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NGFRP08138 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NGFRP08138 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NGFRP08138 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NGFRP08138 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NGFRP08138 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NGFRP08138 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NGFRP08138 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NGFRP08138 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NGFRP08138 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NGFRP08138 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NGFRP08138 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NGFRP08138 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NGFRP08138 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NGFRP08138 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NGFRP08138 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NGFRP08138 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NGFRP08138 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NGFRP08138 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NGFRP08138 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NGFRP08138 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NGFRP08138 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NGFRP08138 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NGFRP08138 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NGFRP08138 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NGFRP08138 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NGFRP08138 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NGFRP08138 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NGFRP08138 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NGFRP08138 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NGFRP08138 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NGFRP08138 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NGFRP08138 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NGFRP08138 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NGFRP08138 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NGFRP08138 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NGFRP08138 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NGFRP08138 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NGFRP08138 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NGFRP08138 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NGFRP08138 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NGFRP08138 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NGFRP08138 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NGFRP08138 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NGFRP08138 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NGFRP08138 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NGFRP08138 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NGFRP08138 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NGFRP08138 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NGFRP08138 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NGFRP08138 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NGFRP08138 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NGFRP08138 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NGFRP08138 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NGFRP08138 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NGFRP08138 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NGFRP08138 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NGFRP08138 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NGFRP08138 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NGFRP08138 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NGFRP08138 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms