Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CENPBP07199 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CENPBP07199 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CENPBP07199 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPBP07199 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPBP07199 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPBP07199 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPBP07199 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPBP07199 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPBP07199 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPBP07199 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPBP07199 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPBP07199 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPBP07199 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPBP07199 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPBP07199 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPBP07199 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPBP07199 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPBP07199 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPBP07199 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPBP07199 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPBP07199 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPBP07199 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPBP07199 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPBP07199 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPBP07199 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPBP07199 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPBP07199 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPBP07199 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPBP07199 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPBP07199 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPBP07199 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPBP07199 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPBP07199 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPBP07199 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPBP07199 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPBP07199 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPBP07199 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPBP07199 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPBP07199 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPBP07199 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPBP07199 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPBP07199 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPBP07199 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPBP07199 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPBP07199 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPBP07199 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPBP07199 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPBP07199 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPBP07199 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPBP07199 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPBP07199 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPBP07199 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPBP07199 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPBP07199 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPBP07199 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPBP07199 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPBP07199 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPBP07199 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPBP07199 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPBP07199 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPBP07199 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPBP07199 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPBP07199 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPBP07199 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPBP07199 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPBP07199 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPBP07199 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPBP07199 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPBP07199 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPBP07199 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPBP07199 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPBP07199 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPBP07199 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPBP07199 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPBP07199 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPBP07199 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPBP07199 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPBP07199 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPBP07199 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPBP07199 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPBP07199 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms